MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 10537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015519	ATTG	2	8	9	16	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015519	GTT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015519	TAT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015519	TTA	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015519	TTC	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015519	GAG	2	6	77	82	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015519	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015519	CAT	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015519	AT	3	6	1580	1585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015519	TTA	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015519	TAC	5	15	1626	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015519	AT	3	6	1648	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015519	TG	3	6	4927	4932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015519	AAAT	2	8	9331	9338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015519	TA	3	6	9351	9356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015519	ATA	2	6	10830	10835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015519	A	6	6	10843	10848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015519	TAAA	2	8	11518	11525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015519	A	7	7	11540	11546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015519	GGT	2	6	12323	12328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015519	ATATA	2	10	13972	13981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015519	AGG	2	6	14018	14023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015519	T	6	6	14757	14762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015519	A	6	6	14782	14787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015519	ATTCT	2	10	16561	16570	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015519	GCA	2	6	16589	16594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015519	TAGCA	2	10	16615	16624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015519	AGT	2	6	16694	16699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015519	TA	3	6	16723	16728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015519	ATA	2	6	18817	18822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015519	CTTAA	2	10	18828	18837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015519	AT	3	6	18891	18896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015519	AGT	2	6	18913	18918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015519	ATT	2	6	18981	18986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015519	TA	3	6	18987	18992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015519	TTTTC	2	10	19121	19130	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015519	AGG	2	6	19212	19217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015519	ATAA	2	8	20677	20684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015519	GCAAA	2	10	20711	20720	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015519	TGG	2	6	20751	20756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015519	TA	3	6	20757	20762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015519	AAG	2	6	20841	20846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015519	TAAT	2	8	20894	20901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015519	TTAA	2	8	20904	20911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015519	T	6	6	22634	22639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015519	TGA	2	6	22661	22666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015519	TA	3	6	22667	22672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015519	A	7	7	22698	22704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015519	AT	3	6	22776	22781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015519	ATA	2	6	22807	22812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015519	AG	3	6	22840	22845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015519	AGG	2	6	26957	26962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015519	ATA	2	6	27164	27169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015519	T	6	6	28310	28315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015519	T	7	7	28365	28371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015519	ATTT	2	8	28388	28395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015519	ATG	2	6	28434	28439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015519	AGG	2	6	28453	28458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015519	GATAAA	2	12	28464	28475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015519	TTG	2	6	28505	28510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015519	T	7	7	29088	29094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015519	T	6	6	29146	29151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015519	CTTT	2	8	29229	29236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015519	TA	3	6	29247	29252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015519	TCC	2	6	30518	30523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015519	T	6	6	31057	31062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015519	CT	3	6	31138	31143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015519	CT	3	6	31202	31207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015519	T	7	7	31254	31260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015519	ATTT	2	8	31278	31285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015519	AG	3	6	31286	31291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015519	TA	3	6	31318	31323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015519	ATA	2	6	31350	31355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015519	TAA	2	6	31420	31425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015519	CAT	2	6	31454	31459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015519	CAT	2	6	31463	31468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015519	TGCT	2	8	31552	31559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015519	TAC	2	6	31589	31594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015519	ATT	2	6	31660	31665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015519	CTG	2	6	31666	31671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015519	TAC	3	9	31770	31778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015519	AAG	2	6	31779	31784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015519	AAATC	2	10	31874	31883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015519	AT	3	6	31913	31918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015519	AAT	2	6	31926	31931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015519	TTTA	2	8	31939	31946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015519	ATTT	2	8	31965	31972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015519	TA	3	6	32109	32114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015519	CTT	2	6	32133	32138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015519	T	7	7	32178	32184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015519	TGA	2	6	32205	32210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015519	TA	3	6	32211	32216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015519	ATA	3	9	32214	32222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015519	AAG	2	6	32245	32250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015519	TAG	2	6	32385	32390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015519	GGT	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015519	T	7	7	32499	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015519	AT	3	6	32519	32524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015519	AGG	2	6	32546	32551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015519	AGA	3	9	33455	33463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015519	TAG	2	6	33473	33478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015519	TCT	2	6	33481	33486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015519	TGT	2	6	33510	33515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015519	TAC	2	6	33893	33898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015519	A	7	7	33909	33915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015519	CAGG	2	8	33948	33955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015519	ATA	2	6	33958	33963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015519	AT	3	6	36797	36802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015519	ACATGA	2	12	36806	36817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015519	TA	3	6	36825	36830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015519	AT	3	6	36851	36856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015519	AAG	2	6	36869	36874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015519	GTAA	2	8	36888	36895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015519	A	6	6	36902	36907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015519	CCT	2	6	36925	36930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015519	TTATGG	2	12	36963	36974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015519	AAT	2	6	36984	36989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015519	T	6	6	36999	37004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015519	T	7	7	37019	37025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015519	TAA	2	6	37031	37036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015519	TTA	2	6	37043	37048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015519	AAACA	2	10	37124	37133	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015519	TAT	2	6	37156	37161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015519	A	6	6	37802	37807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015519	AGA	2	6	37869	37874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015519	TA	3	6	40694	40699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015519	AAG	2	6	40771	40776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015519	GTT	2	6	44698	44703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015519	TA	3	6	44725	44730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015519	TTG	2	6	44740	44745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015519	CTT	2	6	44800	44805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015519	AAG	2	6	44814	44819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015519	AT	3	6	44909	44914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015519	AAG	2	6	44980	44985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015519	CGG	2	6	47463	47468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015519	TAA	2	6	50032	50037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015519	TGT	2	6	50043	50048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015519	ATT	2	6	50056	50061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015519	ATA	2	6	50067	50072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015519	TAA	2	6	50099	50104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015519	GGAA	2	8	50110	50117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015519	T	7	7	50715	50721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015519	TTA	2	6	50734	50739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015519	TTA	2	6	50750	50755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015519	CTA	2	6	50762	50767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015519	TA	3	6	50802	50807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015519	CT	3	6	50844	50849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015519	A	6	6	50850	50855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015519	GAAA	2	8	50878	50885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015519	A	6	6	50898	50903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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